MOS认证考试科目要从软件版本和认证级别两个方面进行分类。
软件版本方面：
MOS认证考试是Office软件上机实操考试，因此MOS认证考试版本和Office软件版本是一一对应的。随着Office软件的迭代， MOS认证考试也在迭代，旧版本的软件不再接受新的考试认证。（但之前通过考试并拿到的证书仍是有效的。）
目前MOS认证考试可进行认证的软件版本是Office2010、Office2013和Office2016。
认证级别方面：
MOS认证考试分为专业级（Specialist）、专家级（Expert）和大师级（Master）三个级别。
MOS认证考试专业级包括Excel、PPT、Word、Access等软件（中国地区可考的科目较国外略有不同），每通过一个软件的考试， 可获得相应的MOS专业级证书（Microsoft Office Specialist）；
MOS认证考试专家级仅包括Excel和Word两个软件，同样，每通过一个软件的考试（2010版每个软件有一科考试、2013版每个软件有两科考试）， 则可获得相应软件的证书（Microsoft Office Specialist Expert）；
MOS认证考试大师级，不需要参加单独的考试，只要拿到指定的几个证书之后， 自动获得大师级证书（Microsoft Office Specialist Master）。
目前MOS认证考试所设所有的科目、对应考试编号、通过考试后可获得的证书、及获得大师级（Master）证书的方法，详见下图：
2017年5月，Office2016上线，更新此回答。